En la región de Magallanes y Antártica Chilena existe un tipo de perro Ovejero que es el resultado de años de selección sobre los primeros perros ovejeros llegados a la región desde territorio británico a fines de 1800 y 1900. La raza se originó a partir de razas caninas ingresadas desde las Islas Falkland a fines del siglo XIX. Dentro de las razas caninas que probablemente le dieron origen se menciona el Old Welsh Grey, antecesor de las razas collies, el Old English Sheepdog y otras razas similares consideradas con aptitud para pastoreo ovino. Sin embargo, en esa época aún no se encontraban definidos los estándares de las diferentes razas caninas y estas razas ovejeras eran conocidas simplemente como Working Collies o Shepherd Dogs.

Por la geografía de la región de Magallanes que constituye una verdadera isla frente al resto del país, por lo que el pool genético del perro Ovejero Magallánico ha logrado mantenerse con leves variaciones hasta la actualidad. Esto ha dado como resultado un perro totalmente adaptado a la zona y cuya selección ha llevado a ciertas variaciones respecto a las razas originarias.